当初，厄里纳斯死亡，巨大的尸体躺在枫丹的土地上，污染了周围的土地和水源。
枫丹处理了污染，但无法处理尸体。
雅各布在里面感受到了深渊的力量，雷内分析，或许可以利用厄里纳斯的血肉来增强雅各布的力量。
但这是推论，为确保安全，他决定先进入自然哲学学院，再利用那里的资源得到安全的实验数据后再来吸收厄里纳斯的血肉，毕竟深渊造物的血肉对人类是剧毒，雷内不敢用雅各布的命去赌。
但雅各布瞒着雷内进入厄里纳斯体内，吸收了它的血肉，好在只是出现了一些排斥反应，没有严重的后果。
一周之后，到了雷内与阿兰见面的日子，四个人还是和小时候一样要好，雷内一直戴着阿兰送给他的怀表。
他们聊了很多，但两人并没有将自己这段时间的遭遇告诉阿兰，因为阿兰的养父埃马纽埃尔也在场。
雷内认识他是执律庭的人，也记得当年的白淞之围。
此时，阿兰已经进入自然哲学学院。
雷内与他约好学院再见。
阿兰向院长举荐了雷内和雅各布二人。
对于他们能否顺利进入，阿兰并不担心。
首先，哲学院院长就是曾经和副院长贝瑟他们一起居住在水仙十字院的德怀特。
其次，他们两人也是学院不可多得的人才。
而雷内和雅各布在此期间也没有闲着，继续测试雅各布的力量，并时不时吸收厄里纳斯的血肉。
厄里纳斯确实死了，尸体失去了活性，但意识还在。
每次雅各布的行动它都知道，并很高兴自己可以帮助他的忙。
经过一段时间吸收，雅各布可以短暂打开连接深渊的“通道”，通道里常常钻出兽境猎犬。雅各布很害怕，一边哭一边把它们消灭了。
学院的通知很快下来了，雷内和雅各布毫不意外地被录取，他们被分配到阿兰的实验室里。
然而，学院的其他成员却对他们颇有微词，出于对他们才能的畏惧与嫉妒，研究员们十分厌恶这两位新成员。
但碍于学院长德怀特，他们无法对雷内等人做出应激行为。
雷内因为被分配到阿兰身边，之前的实验不能开展下去。
不过他并不着急，自己有的是时间。
此时，阿兰正在埋头研究机械和荒芒能量可控性湮灭的技术。
如果成功，不仅可以解决枫丹的能源问题，还能以此弄清荒芒能量的本质。
在此期间，雷内对院内的研究员们进行考察，但失望的是，这里的人员实力平平，根本没有可以称得上天才的人，甚至对自己和阿兰抱有敌意。
但是，雷内此时急需人脉与资源，他必须去拉拢他们。
而雅各布这段时间的变化让雷内十分高兴，雷内相信，只要让更多的人接受深渊的力量，末日的问题很快就能迎刃而解。
一日，上面下达了一则前往田野调查的任务，带领雷内的人则是阿兰的助手卡特。
卡特与其他研究员不同，对雷内他们没有敌意，这次的任务本质上也是出去放松游玩。
一行人来到了佩特莉可镇，玛丽安也在。
他们玩的很开心，卡特用留影机拍摄了很多照片，尤其是玛丽安。
卡特认为，阿兰总是忙于研究，没机会见证妹妹的成长，将来一定会后悔，于是决定帮他留下纪念。
阿兰自然是不知道卡特的良苦用心，他和雷内在玩耍中也不忘了工作。
佩特莉可镇建立在古代文明雷穆利亚的遗址上，两人对这里的遗迹非常感兴趣。
经过这次游玩，众人的关系拉近了不少，而雷内与阿兰也了解到了卡特的身体状况。
卡特患上了一种难以治愈的疾病，平时经常要休假养病。
雷内后知后觉，他觉得时间紧迫，需要尽快展开研究，说不定可以治愈卡特的病。
雷内将自己的想法与计划告诉了阿兰，希望可以得到好友的帮助，但阿兰对自己的能力过于自信，他并不相信雷内，拒绝了他。
雷内没有放弃，他和雅各布已经在学院里收拢了不少人，如果能说服他们，也能得到很大的帮助。
于是，雷内和雅各布制作起了『揭示之书』，这本书会呈现出人们心中最接近末日的景象。
他们在书中留下了纸条，拉拢来到这里的人。
之后，雷内向学院长德怀特申请了自己研究深渊的计划。
考虑到如今的枫丹遍布污染的现状，雷内的计划获得批准并获得了自己的实验室。
在实验室里，雷内研究起了深赤之石、黑泥等与深渊有关的东西。
目前，吸收深渊力量而获得进化的样本只有雅各布一例，雷内迫切需要做的，就是增加样本的数量，来证明自己计划的可行性，重新雅各布的奇迹。
然而，现在的他不能肆意去做人体实验，研究很快到